我們知道因為大部分霉菌生存環境溫度要求在室溫25℃左右，還有需要保持一定的濕度。所以霉菌培養箱一般由制冷系統，制熱系統，空氣加濕器和培養室，控制電路和操作面板等部分組成，并使用溫度傳感器和濕度傳感器來維持培養室內的溫度和濕度的穩定。
1、首先利用霉菌培養箱底部的調節螺釘調節好高度，使箱體平穩放置于地面。
2、保證電源安全接地，連接電源，開啟電源開關，顯示屏亮，這時顯示屏所顯示的是培養箱室內的實際溫度和濕度。
3、安裝加濕器：把加濕器的電源插頭插在儀器背部的電源插座上，再連接儀器的加濕管和加濕器，連接一定要緊密，在加濕器水箱里注水要根據說明書來操作。
4、調節溫度：按下溫度設置按鈕，數字顯示為設定值，將溫度調節電位器旋到所需溫度值，數字顯示的就是培養室內的實際溫度，如果這時培養箱內的實際溫度比設定溫度要小，加熱指示燈亮，加熱器自動開始加熱；若培養箱內的實際溫度大于設定溫度，制冷指示燈亮，制冷系統自動開始制冷；如果加熱指示燈及制冷指示燈都是暗的，說明霉菌培養箱此時處于恒溫狀態。
5、調節濕度：按動濕度設置按鈕，數字顯示即設定值，把調節電位器旋至所需濕度值，這時數字顯示的就是霉菌培養箱內的實際濕度。同溫度一樣，在培養室內的實際濕度小于設定濕度時，加濕器會自動加濕，加濕指示燈是亮的狀態；培養室內的實際濕度大于設定的濕度時，加濕器燈暗自動停止工作。
6、霉菌培養箱箱內不需要殺菌時，要關閉面板上的殺菌開關。
7、霉菌培養箱溫度設定好之后，不要隨意反復旋轉控溫旋鈕，這樣會引起壓縮機頻繁啟動，使壓縮機出現過載現象，縮短壓縮機的使用壽命。
8、霉菌培養箱背部裝有二組保險盒，2A為制冷加熱負載保險絲盒，8A為控制電源保險絲盒，如果機器運轉出現故障，比控溫失靈、不加熱、不制冷等，就要立即切斷電源，分別檢查保險絲是否完好，再檢查相應部位。